Директорът:
- 1. ръководи и отговаря за цялостната дейност на центъра и го представлява пред всички държавни органи, учреждения, организации, физически и юридически лица в страната и в чужбина;
- 2. в изпълнение на своите задължения издава заповеди и инструкции;
- 3. определя вътрешната структура на центъра на базата на утвърдената численост на персонала;
- 4. управлява средствата, предоставени му от бюджета като второстепенен разпоредител, както и средствата от собствена научна, научно-приложна, учебна, диагностична и експертна дейност;
- 5. утвърждава правилника за вътрешния ред; инструкцията за документооборота, деловодната и архивната дейност; системата за финансово управление и контрол; инструкцията за работа при здравословни и безопасни условия на труд, длъжностните характеристики на служителите и други вътрешни актове;
- 6. изготвя годишен отчет за дейността на центъра, който представя на министъра на здравеопазването след одобрение от общото събрание на центъра;
- 7. изпълнява други задачи, възложени му от министъра на здравеопазването.