(1) Агенцията е юридическо лице и администрация към министъра на околната среда и водите за осъществяване на прилагането на изискванията на законодателството и нормативната уредба, свързани с околната среда, в т.ч. ръководство на Националната система за мониторинг на околната среда (НСМОС), със седалище в гр. София и с адрес на управление гр. София, бул. "Цар Борис III" № 136.
(2) Изпълнителният директор на Агенцията е второстепенен разпоредител с бюджет по бюджета на Министерството на околната среда и водите (МОСВ).