(1)(В сила от 01.01.2003 г., предишен текст на чл. 55, изм. - ДВ, бр. 80 от 2010 г., изм. - ДВ, бр. 14 от 2015 г.) Редът за установяване, събиране, разходване и контрол на средствата, както и размерът на дължимите вноски се определят с наредба, приета от Министерския съвет по предложение на министъра на енергетиката и министъра на финансите.
(2)(Нова - ДВ, бр. 80 от 2010 г., изм. - ДВ, бр. 14 от 2015 г.) Управителният съвет на фонда по предложение на министъра на енергетиката приема методология за определяне на разходите по финансиране на извеждането от експлоатация и съответно за определяне на дължимите вноски. Методологията трябва да отчита технологичните аспекти и изискванията за ядрена безопасност и радиационна защита.