Приходите на Националния иновационен фонд се осигуряват от:
- 1. средства от държавния бюджет;
- 2. средства въз основа на споразумения, дарения и помощи от национални и международни финансови институции и организации и средства по международни споразумения;
- 3. дарения от физически и юридически лица;
- 4. средства по съвместни програми с публични и частни български и чуждестранни фондове за рисково финансиране;
- 5. средства по програми на Европейския съюз и държавите от Европейското икономическо пространство.