Органи на управление на НЗОК са:
- 1. надзорният съвет;
- 2.(доп. - ДВ, бр. 96 от 2023 г., в сила от 17.11.2023 г., изм. - ДВ, бр. 73 от 2025 г., в сила от 05.09.2025 г.) управителят и двамата подуправители.