(1) Извънредните проверки се извършват по преценка на изпълнителния директор на агенцията без предварително уведомяване на лечебното заведение.
(2) Извънредни проверки могат да се провеждат по искане на министъра на здравеопазването, по сигнали на граждани и други заинтересовани лица и организации.
(3) Изпълнителна агенция „Медицински одит“ може да се самосезира и да извършва проверки при получена информация за здравни неблагополучия и/или нарушения при извършване на лечебната дейност.