(1) Според разпределението на функциите администрацията на центъра е обща и специализирана.
(2) Общата администрация е организирана в дирекция “Административно-правно, финансово и информационно обслужване”.
(3) Специализираната администрация е организирана в дирекция “Управление на проекти по европейски и международни младежки програми”.