Специфичните одитни дейности по фондове и програми на Европейския съюз включват:
- 1. одити на системите за оценка на правилното функциониране на системите за управление и контрол на съответната оперативна програма;
- 2. одити на операциите за оценка на законосъобразността и редовността на декларираните пред Европейската комисия разходи;
- 3. одити на отчетите за оценка на пълнотата, точността и верността на сумите, декларирани в годишните счетоводни отчети;
- 4. издаване на годишни контролни доклади, годишни становища и декларации за приключване на програмите, съфинансирани от фондове на Европейския съюз, които обобщават резултатите от изпълнените одитни дейности по т. 1 - 3.