Общата администрация е организирана във:
- 1. дирекция "Човешки ресурси";
- 2. дирекция "Правни дейности и законодателство на Европейския съюз";
- 3. дирекция "Финанси и управление на собствеността";
- 4.(изм. - ДВ, бр. 9 от 2024 г., в сила от 01.02.2024 г.) дирекция "Стопански дейности и инвестиции";
- 5. дирекция "Административно обслужване";
- 6. дирекция "Информационно и комуникационно обслужване";
- 7. дирекция "Обществени поръчки";
- 8. дирекция "Сигурност";
- 9. дирекция "Връзки с обществеността и протокол".