Специализираната администрация е организирана в три дирекции, както следва:
- 1. дирекция "Експертиза и закрила на изобретенията, полезните модели и промишлените дизайни";
- 2. дирекция "Експертиза и опозиция на марките и географските означения";
- 3. дирекция "Спорове и административнонаказателна дейност".