Научният секретар на Института по отбрана е нещатна изборна длъжност. Той подпомага работата на директора на Института по отбрана в научната област и отговаря за:
- 1. програмната акредитация в съответствие с изискванията на ЗВО;
- 2. организирането на научноизследователската дейност;
- 3. развитието на научния кадрови потенциал, като организира и осъществява методическо ръководство и контрол на допълнителните дейности, обслужващи обучението на докторантите и повишаване квалификацията на специалистите;
- 4. организирането на атестацията на научните кадри;
- 5. изготвянето на предложения за обявяване на конкурси за заемане на академични длъжности;
- 6. контрола при провеждането на процедурите за заемане на академични длъжности, назначаването на академичен състав и за обучението в докторантура;
- 7. други задачи, възлагани му от директора на института.