Дирекция "Разследване" е на пряко подчинение на Комисията, като:
- 1. извършва разследване на корупционни престъпления по чл. 3, ал. 1 от Закона за противодействие на корупцията сред лица, заемащи публични длъжности, в случаите, при условията и по реда на Наказателно-процесуалния кодекс;
- 2. участва в подготовката на проекти на съвместни инструкции за взаимодействие с органите на досъдебното производство и други държавни органи при извършване на разследване на корупционни престъпления.