(1)(Изм. - ДВ, бр. 64 от 2006 г., изм. - ДВ, бр. 69 от 2008 г., предишен текст на чл. 49 - ДВ, бр. 80 от 2018 г., в сила от 28.09.2018 г.) От бюджета на агенцията се финансират разходи при спазване на следните приоритети:
- 1. изплащане на българско дялово участие по финансиране на програми въз основа на сключени международни договори, по които Република България е страна;
- 2. изплащане на главница, лихви и такси по заеми, отпуснати от международни финансови институции по т. 1;
- 3.(изм. - ДВ, бр. 64 от 2006 г., изм. - ДВ, бр. 69 от 2008 г.) погашения на главница, лихви и такси по вътрешни заеми, които агенцията е получила;
- 4.(изм. - ДВ, бр. 69 от 2008 г.) изграждане, ремонт и поддържане на републиканските пътища, включително местата на пресичането им с железопътната мрежа;
- 5. изграждане, ремонт и поддържане на общинските пътища;
- 6. проучвателни, проектни и научноизследователски разработки по т. 4 и 5;
- 7. национални и общински програми за повишаване на безопасността на движението по републиканските и общинските пътища.
(2)(Нова - ДВ, бр. 80 от 2018 г., в сила от 28.09.2018 г.) Средствата от такси по чл. 10, ал. 1, т. 2 се разходват в съответствие с принципите, установени в Директива 1999/62/ЕО.