(1) Организацията на работата в Агенцията, оперативната дейност и документооборотът се уреждат с вътрешни правила, инструкции и заповеди на изпълнителния директор.
(2) Във връзка с организацията на работата на Агенцията може да се използват утвърдени софтуерни продукти и програми.