(1) Оценката се основава на използването на обективни и лесно проверими данни от независими източници. Основни източници и инструменти на системата са:
- 1. световните научни бази данни - Scopus, Web of Science (All Databases);
- 2. бази данни, поддържани от Directory of Intellectual Property Offices - WIPO, European Patent Office (EPO), United States Patent and Trademark Office, BPO Online - database of Bulgarian Patent Office;
- 3. Регистър за научноизследователската дейност в Република България;
- 4. Регистър на действащите, прекъсналите и завършилите студенти и докторанти;
- 5. Регистър на академичния състав и защитените дисертационни трудове;
- 6. Регистър на висшите училища;
- 7. отчет за дейността на Фонд "Научни изследвания";
- 8. финансово-счетоводни справки от научните организации и висшите училища за привлечените средства по европейски рамкови програми за научни изследвания и иновации, националните и международните проекти, по които през съответния отчетен период са изразходвани парични средства от конкурсно-проектно финансиране, и размера на изразходваните средства по тези проекти, и за привлечените средства по договорите с български или чуждестранни предприятия и/или организации, както и от сключени лицензионни договори с фирми/земеделски производители за реализация на интелектуални продукти, по които през отчетния период са изразходвани парични средства, и размера на изразходваните средства по тези договори;
- 9. Българският портал за отворена наука.
(2) За изготвяне анализа на научноизследователската дейност, осъществявана от оценяваните организации, допълнителни източници на системата могат да представляват данни, подадени от оценяваните организации, както и независими оценки и доклади на институциите на ЕС и на Министерството на образованието и науката.