(1) Структурата на музея се определя в зависимост от тематичния му обхват и формираните фондове и включва специализирани отдели и администрация.
(2) Специализирани отдели са:
- 1. "Фондове и експозиции";
- 2. "Научноизследователски лаборатории и теренни изследвания, научна група и научен архив".
(3) Администрацията включва следните отдели:
- 1. "Административно-финансов";
- 2. "Връзки с обществеността".