Сертифициращият орган въз основа на процедурите и извадка от транзакциите издава сертификат, който удостоверява:
- 1. че агенцията е извършила проверка за спазване на изискванията на законодателството на ЕС преди извършване на плащанията;
- 2. верността, пълнотата и точността на финансовите отчети;
- 3. правилното функциониране на системата за контрол в Разплащателната агенция.