(1) Органи на агенцията са:
- 1. надзорният съвет;
- 2. изпълнителният директор.
(2) Помощен орган на агенцията е Експертният технико-икономически съвет, който разглежда, приема и предлага на изпълнителния директор за утвърждаване разработки и проекти за изграждане, ремонт и поддържане на републиканските пътища.
(3) Експертният технико-икономически съвет изпълнява функциите на държавно-обществен орган в областта на пътищата в случаите, определени със заповед на изпълнителния директор на агенцията.
(4) Съставът на Експертния технико-икономически съвет се определя със заповед на изпълнителния директор на агенцията. Със заповедта се определя възнаграждението на участниците в съвета, което е за сметка на бюджета на агенцията.