(1) Многопрофилните транспортни болници се състоят от 4 функционално обособени структурни блока:
- 1. консултативно-диагностичен, който включва: а) приемно-консултативни кабинети; б) медико-диагностични и медико-технически лаборатории; в) отделения без легла или кабинети за функционална и образна диагностика;
- 2. стационарен, който включва клиники и/или отделения с легла;
- 3. болнична аптека;
- 4. административно-стопански.
(2) В многопрофилните транспортни болници функционират транспортни областни лекарски експертни комисии (ТОЛЕК), чийто състав се определя със заповед на директора на болницата.
(3) В Националната многопрофилна транспортна болница "Цар Борис III" функционират и:
- 1.(изм. - ДВ, бр. 96 от 2005 г., в сила от 01.12.2005 г., изм. - ДВ, бр. 25 от 2015 г.) Транспортна централна лекарска експертна комисия (ТЦЛЕК), чийто състав се определя със заповед на министъра на транспорта, информационните технологии и съобщенията;
- 2. Комисия за авиомедицинско освидетелстване (КАМО), чийто състав се определя със заповед на директора на болницата;
- 3.(нова - ДВ, бр. 13 от 2003 г.) експертно-консултативни отделения на територията на страната, извършващи функциите по чл. 3, ал. 2, т. 2, 3 и 4 за съответния район на страната, който обслужват.