При изпълнение на своята дейност Националният съвет си сътрудничи със:
- 1.(изм. - ДВ, бр. 107 от 2013 г.) Комисията за защита от дискриминация, Омбудсмана на Република България, Съвета за електронни медии, комисии на Народното събрание, администрацията на Президента на Република България, органи на съдебната власт, други държавни органи;
- 2.(изм. - ДВ, бр. 31 от 2011 г., в сила от 15.04.2011 г.) областните съвети за сътрудничество по етническите и интеграционните въпроси, органите на местното самоуправление, висши училища, научни институти и други организации;
- 3. аналогични структури в други държави и международни организации;
- 4.(изм. - ДВ, бр. 31 от 2011 г., в сила от 15.04.2011 г., изм. - ДВ, бр. 107 от 2013 г.) юридически лица с нестопанска цел, които работят в областта на междуетническите отношения и защитата на правата на човека;
- 5.(отм. - ДВ, бр. 107 от 2013 г.)