Чл. 11

(1)(Изм. - ДВ, бр. 47 от 2005 г., в сила от 01.01.2006 г., изм. - ДВ, бр. 106 от 2006 г., в сила от 27.12.2006 г.) Главният секретар осъществява административното ръководство на агенцията, осигурява организационната връзка между звената в администрацията, координира и контролира оперативната дейност на агенцията в изпълнение на разпорежданията на председателя, работи под негово ръководство и се отчита за своята дейност пред него.

(2)(Изм. - ДВ, бр. 47 от 2005 г., в сила от 01.01.2006 г., изм. - ДВ, бр. 106 от 2006 г., в сила от 27.12.2006 г.) Главният секретар:

1. 1. отговаря за планирането и отчетността при изпълнение на ежегодните цели на администрацията;
2. 2. ръководи дейността по управление на човешките ресурси;
3. 3. ръководи административното обслужване;
4. 4. осигурява организационната връзка между председателя и административните звена в агенцията, както и между административните звена;
5. 5. организира разпределението на задачите между административните звена в агенцията, като създава условия за ефективна работа;
6. 6. осъществява общия контрол за изпълнението на възложените задачи;
7. 7. ръководи, контролира и отговаря за работата с документите и за съхраняването им и за опазването на служебната тайна;
8. 8. осъществява контрол по вписванията в Административния регистър и в Системата за самооценка на административното обслужване;
9. 9. координира и контролира управлението на ползваните за административни нужди недвижими имоти и движими вещи, предоставени на агенцията;
10. 10.(изм. - ДВ, бр. 7 от 2016 г., в сила от 01.02.2016 г.) отговаря и контролира провеждането на процедури за възлагане на обществени поръчки;
11. 11. осъществява координация и контрол в процеса на подготовката и изпълнението на бюджета и следи за законосъобразното и целесъобразното разходване на средствата на агенцията;
12. 12. утвърждава длъжностните характеристики на служителите;
13. 13. представлява агенцията в случаите, в които е упълномощен изрично от председателя, по проблеми, свързани с функционирането на администрацията;
14. 14. изготвя ежегоден доклад за състоянието на администрацията на агенцията и го представя на председателя;
15. 15. изпълнява и други задачи, възложени му от председателя.

(3)(Нова - ДВ, бр. 47 от 2005 г., в сила от 01.01.2006 г.) При отсъствие на главния секретар неговите функции за всеки конкретен случай се изпълняват от определен от председателя на агенцията директор на дирекция.