(1) Структурните звена в агенцията си взаимодействат при изпълнение на задачи от смесена компетентност.
(2) За повишаване на качеството и ефективността на контролната дейност на агенцията се осигурява гъвкаво разпределение на човешки ресурси, като със заповед на изпълнителния директор се определят комисии за извършване на проверки от служители на структурите от специализираната администрация.