(1) Изпълнителният директор:
- 1. организира, ръководи и контролира цялостната дейност на агенцията;
- 2.(изм. - ДВ, бр. 76 от 2008 г., в сила от 01.09.2008 г., изм. - ДВ, бр. 64 от 2018 г., в сила от 03.08.2018 г.) представя на министъра на земеделието, храните и горите ежегоден доклад за дейността на агенцията;
- 3. участва в разработването на нормативни актове в областта на посочените в чл. 2 дейности;
- 4. управлява движимото и недвижимото имущество на агенцията;
- 5. утвърждава щатното разписание на агенцията;
- 6. утвърждава длъжностните характеристики на служителите в агенцията;
- 7. издава заповеди, свързани със служебните и трудовите правоотношения;
- 8. сключва договори, свързани с осъществяването на дейността на агенцията;
- 9.(нова - ДВ, бр. 91 от 2013 г., в сила от 18.10.2013 г., изм. - ДВ, бр. 64 от 2018 г., в сила от 03.08.2018 г.) подготвя и предлага на министъра на земеделието, храните и горите национална стратегия за дейността на агенцията;
- 10.(нова - ДВ, бр. 91 от 2013 г., в сила от 18.10.2013 г., изм. - ДВ, бр. 64 от 2018 г., в сила от 03.08.2018 г.) предлага на министъра на земеделието, храните и горите за утвърждаване годишния проектобюджет на агенцията;
- 11.(нова - ДВ, бр. 91 от 2013 г., в сила от 18.10.2013 г.) обявява списъка на информацията, подлежаща на класификация като служебна тайна в съответствие със Закона за защита на класифицираната информация;
- 12.(нова - ДВ, бр. 91 от 2013 г., в сила от 18.10.2013 г.) сформира екипи, работни групи и комисии за изпълнение на задачи на агенцията;
- 13.(нова - ДВ, бр. 91 от 2013 г., в сила от 18.10.2013 г.) утвърждава процедури и вътрешни правила, свързани с дейността и организацията на работа на агенцията, в рамките на своята компетентност.
(2)(Изм. - ДВ, бр. 76 от 2008 г., в сила от 01.09.2008 г., изм. - ДВ, бр. 64 от 2018 г., в сила от 03.08.2018 г.) Изпълнителният директор изпълнява и други функции, възложени му от министъра на земеделието, храните и горите.
(3) Функциите на изпълнителния директор в негово отсъствие се изпълняват от определен от него с писмена заповед служител на агенцията.