(1) Административната структура на агенцията включва обща и специализирана администрация.
(2) Общата администрация е организирана в дирекция "Административно-правно и финансово-стопанско обслужване".
(3) Специализираната администрация е организирана в дирекция "Акредитация на органи за оценяване на съответствието".
(4) Изпълнителният директор може да създава със заповед отдели и сектори.