Взаимодействието между институциите чрез системата се осъществява при спазване на принципите за:
- 1. прилагане на междуведомствени правила за ползване и администриране на националната система;
- 2. прилагане на общи технологични, комуникационни и информационни стандарти;
- 3. съгласувана защита на данните в системата и свързаните чрез нея вътрешноведомствени системи;
- 4. съгласувано ресурсно осигуряване;
- 5. съгласуване на ведомствените интереси.