Приходите на Центъра се формират от следните източници чрез бюджета на Министерството на земеделието и храните:
- 1. субсидия от държавния бюджет;
- 2. субсидии по международни програми и проекти;
- 3. приходи от консултантска дейност;
- 4. дарения и помощи;
- 5. други приходи, предвидени в нормативен акт.