Специализираната администрация е организирана в четири дирекции:
- 1. дирекция "Информационни дейности и удостоверяване на образователни документи";
- 2. дирекция "Информационно осигуряване на академичния състав и научната дейност";
- 3. дирекция "Академично признаване и регулирани професии"; и 4. дирекция "Научно-техническа и педагогическа библиотека".