Съветът има следните функции:
- 1. организира и извършва научни изследвания във връзка с изпълнение на наказанията;
- 2. разработва методически указания за дейността на местата за лишаване от свобода и пробационните служби;
- 3. подготвя проекти на нормативни актове във връзка с изпълнение на наказанията;
- 4. съдейства за организиране и провеждане на първоначалното професионално обучение и за повишаването на професионалната квалификация на служителите от Главна дирекция "Изпълнение на наказанията" (ГДИН) и териториалните й служби;
- 5. работи за изграждане на обществено доверие към дейността на ГДИН и териториалните й служби.