(Изм. - ДВ, бр. 103 от 2012 г., в сила от 01.01.2013 г., изм. - ДВ, бр. 13 от 2014 г., в сила от 01.01.2014 г.) Центърът осъществява следните функции:
- 1. организационно и финансово подпомагане на български граждани и лица по чл. 83, ал. 1 и 3 от Закона за здравето за извършване на дейности по асистирана репродукция в лечебни заведения в Република България;
- 2.(изм. и доп. - ДВ, бр. 4 от 2018 г., в сила от 01.01.2018 г.) контрол върху дейността по асистирана репродукция, отчетността на медицинската, финансовата и друга документация и успеваемостта на лечебните заведения, получили финансиране от центъра, както и за спазване на чл. 39г;
- 3. организиране и провеждане на дейности за набиране на финансови средства за осъществяване дейността на центъра;
- 4. даване на методически указания относно процедурите по отпускане, разходване и отчитане на финансовите средства за асистирана репродукция, предоставени от центъра;
- 5. провеждане на информационна политика относно дейностите по асистирана репродукция, майчино и детско здравеопазване;
- 6. създаване и поддържане на регистър на лицата, които са подали заявления за организационно и финансово подпомагане от центъра за извършване на асистирана репродукция, и на информацията по т. 1 - 7 от приложение № 1;
- 7. обработване на данни, свързани с демографски въпроси в областта на здравеопазването в Република България, и осъществяване на сътрудничество с компетентните институции в тези области;
- 8. участие в изпълнението на проекти и програми в областите на дейност по т. 1 - 7.