(1)(Доп. - ДВ, бр. 8 от 2019 г., изм. - ДВ, бр. 103 от 2025 г.) Комисията при осъществяване на своите функции и правомощия се подпомага от специализирана и обща администрация, която е организирана в дирекции. Общото административно ръководство на администрацията се осъществява от главен секретар, който е на пряко подчинение на председателя на комисията. Оперативното ръководство на дирекциите се осъществява от директорите на дирекции.
(2)(Изм. - ДВ, бр. 12 от 2025 г.) Дейността на администрацията се осъществява от държавни служители и от лица, работещи по трудово правоотношение. За работещите по трудово правоотношение се прилага чл. 107а от Кодекса на труда. За администрацията на комисията се прилага Законът за администрацията, доколкото не противоречи на ЗНФОИСУ.
(3)(Изм. - ДВ, бр. 14 от 2018 г., изм. - ДВ, бр. 12 от 2025 г.) Общата численост на администрацията е 35 щатни бройки, разпределени по структурни звена и длъжности съгласно приложението.
(4) Председателят и служителите на комисията имат право на:
- 1. допълнителен платен годишен отпуск за изпълнение на задълженията извън работно време; конкретният размер на отпуска на председателя се определя с решение на комисията, а на служителите - със заповед на председателя;
- 2. повишаване на професионалната квалификация и преквалификация за сметка на бюджета на комисията при спазване разпоредбите на чл. 35 от Закона за държавния служител;
- 3.(изм. - ДВ, бр. 91 от 2020 г.) представително облекло съгласно Наредбата за служебното положение на държавните служители, приета с ПМС № 34 от 2000 г., като конкретният размер на средствата се определя от председателя на комисията за всяка календарна година.
(5)(Изм. - ДВ, бр. 103 от 2025 г.) За осъществяване на своята дейност и при необходимост председателят или комисията могат да привличат външни сътрудници и експерти.