Центърът осъществява функциите на:
- 1. специализиран орган на Министерството на здравеопазването по проблемите на онкологията;
- 2. организационно-методичен ръководител на онкологичните заведения в страната;
- 3. експертен и контролен орган в областта на онкологията;
- 4. национален координатор по онкология.