(1) При изпълнение на правомощията по чл. 8 директорът на Комендантство - МО, се подпомага от заместник-директор.
(2) Заместник-директорът на Комендантство - МО, е военнослужещ и:
- 1. координира дейността на структурните звена за точното изпълнение на заповедите и разпорежданията на директора на Комендантство - МО, както и взаимодействието с административните звена на Министерството на отбраната, структурите на пряко подчинение на министъра на отбраната, Българската армия, други държавни органи, ведомства и организации;
- 2.(изм. - ДВ, бр. 58 от 2012 г., в сила от 01.08.2012 г.) изготвя целите и приоритетите на програмата на Комендантство - МО, и ръководи изготвянето на Програмния меморандум на Комендантство - МО;
- 3. организира изготвянето на частта за Комендантство - МО, от Единния финансов план за материално-техническо осигуряване на Министерството на отбраната, структурите на пряко подчинение на министъра на отбраната и Българската армия и от Единния поименен списък на обектите за строителство и строителни услуги на Министерството на отбраната, структурите на пряко подчинение на министъра на отбраната и Българската армия;
- 4. координира дейностите за недопускане на злоупотреби и корупция, повишаване на прозрачността и осъществяване на ефективното управление на движимите вещи, материално-техническите и финансовите средства на Комендантство - МО, и дава предложения на директора за осигуряване на баланс между наличните ресурси и извършваните разходи;
- 5. координира и съгласува изготвянето на месечните планове и годишния план за работа на Комендантство - МО, и следи за тяхното изпълнение;
- 6.(изм. - ДВ, бр. 58 от 2012 г., в сила от 01.08.2012 г.) координира и участва в изготвянето на ежегодния доклад за дейността на Комендантство - МО, и ежегодния доклад за състоянието на Комендантство - МО, по чл. 62, ал. 1 от Закона за администрацията;
- 7. изпълнява и други задачи, възложени му от директора на Комендантство - МО.
(3) Функциите на директора на Комендантство - МО, при негово отсъствие или когато ползва законоустановен отпуск, се осъществяват от заместник-директора.