(1)(Нова - ДВ, бр. 94 от 2017 г., изм. - ДВ, бр. 46 от 2024 г., в сила от 01.06.2024 г.) Агенцията е юридическо лице на бюджетна издръжка.
(2)(Предишен текст на чл. 2 - ДВ, бр. 68 от 2016 г., в сила от 30.08.2016 г., предишна ал. 1 - ДВ, бр. 94 от 2017 г.) Изпълнителният директор на агенцията е второстепенен разпоредител с бюджет към министъра на земеделието и храните.
(3)(Нова - ДВ, бр. 68 от 2016 г., в сила от 30.08.2016 г., предишна ал. 2 - ДВ, бр. 94 от 2017 г.) Бюджетът на агенцията се определя ежегодно със закона за държавния бюджет на Република България за съответната година.