Регионалните поделения на предприятието са:
(Изм. - ДВ, бр. 100 от 2010 г., в сила от 01.01.2011 г., изм. - ДВ, бр. 99 от 2012 г., в сила от 01.01.2013 г.) Регионалните поделения на предприятието са:
- 1. Управление движението на влаковете и гаровата дейност - София;
- 2. Управление движението на влаковете и гаровата дейност - Пловдив;
- 3. Управление движението на влаковете и гаровата дейност - Горна Оряховица;
- 4. Железопътна секция - Враца;
- 5. Железопътна секция - Горна Оряховица;
- 6. Железопътна секция - Пловдив;
- 7. Железопътна секция - София;
- 8.(нова - ДВ, бр. 53 от 2017 г., в сила от 04.07.2017 г.) Железопътна секция - Бургас;
- 9.(нова - ДВ, бр. 53 от 2017 г., в сила от 04.07.2017 г.) Железопътна секция - Шумен.