Общата администрация е организирана във:
- 1. дирекция „Човешки ресурси“;
- 2. дирекция „Правни дейности и законодателство на Европейския съюз“;
- 3. дирекция „Финанси и управление на собствеността“;
- 4. дирекция „Стопански дейности, инвестиции и хидромелиорации“;
- 5. дирекция „Административно обслужване“;
- 6. дирекция „Информационно и комуникационно обслужване“;
- 7. дирекция „Обществени поръчки“;
- 8. дирекция „Сигурност“;
- 9. дирекция „Връзки с обществеността и протокол“.