Центърът осъществява функции на експертен орган във връзка със:
- 1. създаването и използването на документна основа за регистрация и отчитане на здравното състояние, ресурсите в здравеопазването и здравеопазните дейности;
- 2. създаването и експлоатацията на информационните технологии;
- 3. финансирането на информационните технологии;
- 4. следдипломното обучение на специалистите, работещи в информационните структури в системата на здравеопазването;
- 5. количеството и качеството на информационната дейност;
- 6. националните и международните програми в частта им, отнасяща се до информационните аспекти.