(1) Специализираната администрация на агенцията е организирана във:
- 1. Главна дирекция "Ядрена безопасност";
- 2. дирекция "Анализи и оценки на безопасността";
- 3. дирекция "Радиационна защита";
- 4. дирекция "Международно сътрудничество".
(2) Дирекциите по ал. 1 подпомагат и осигуряват осъществяването на правомощията на председателя на агенцията по ЗБИЯЕ.
(3) В състава на Главна дирекция "Ядрена безопасност" се включва териториалното звено в Козлодуй, което има статут на отдел и осъществява контрол на ядрената безопасност и радиационната защита на съоръженията на площадката на АЕЦ "Козлодуй" в рамките на предоставената му от председателя на агенцията компетентност по реда на правилника. Териториалното звено ползва длъжностите, установени с Класификатора на длъжностите в администрацията, при спазване на изискванията, залегнали в него.