(1) Специализираните звена на фонда са: управление “Пътни такси и разрешителни”, Централната лаборатория по пътища и мостове и 27 областни пътни управления.
(2) Управление “Пътни такси и разрешителни” е със статут на главна дирекция, а Централната лаборатория по пътища и мостове е със статут на дирекция.