(1) Орган от първо ниво е министърът на отбраната, който се подпомага от дирекция “Планиране и управление на бюджета” при планиране и изпълнение на годишния бюджет на Министерството на отбраната съгласно чл. 25 от Устройствения правилник на Министерството на отбраната.
(2) Органи от второ ниво са второстепенните разпоредители с бюджетни кредити, които се определят с постановление на Министерския съвет.
(3) Органи от трето ниво са структурите, подчинени на второстепенните разпоредители с бюджетни кредити.