Специализираната администрация е организирана във:
- 1. Инспекторат на министъра на правосъдието по Закона за съдебната власт;
- 2. дирекция "Съвет по законодателство";
- 3.(изм. - ДВ, бр. 64 от 2025 г.) дирекция "Стратегическо развитие, програми и проекти";
- 4. дирекция "Международно правно сътрудничество и европейски въпроси";
- 5. дирекция "Взаимодействие със съдебната власт";
- 6. дирекция "Процесуално представителство на Република България пред Европейския съд по правата на човека";
- 7. (нова - ДВ, бр. 60 от 2022 г., в сила от 01.09.2022 г., отм., предишна т. 8 - ДВ, бр. 70 от 2022 г., в сила от 31.08.2022 г. (*), изм. - ДВ, бр. 64 от 2025 г.) дирекция "Информационни системи, дигитализация и електронни регистри";
- 8. (предишна т. 7 - ДВ, бр. 60 от 2022 г., в сила от 01.09.2022 г., отм., предишна т. 9 - ДВ, бр. 70 от 2022 г., в сила от 31.08.2022 г. (*)) дирекция "Българско гражданство";
- 9. (предишна т. 8 - ДВ, бр. 60 от 2022 г., в сила от 01.09.2022 г., отм., предишна т. 10 - ДВ, бр. 70 от 2022 г., в сила от 31.08.2022 г. (*)) дирекция "Международна правна закрила на детето и международни осиновявания".