(1) Агенцията се ръководи и представлява от изпълнителен директор.
(2) Изпълнителният директор се назначава от министъра на образованието и науката съгласувано с министър-председателя за срок 5 години без ограничения за броя на мандатите, за които едно лице може да заема тази длъжност.