Основните функции и задачи на ГСС са:
- 1. изпитване и определяне произхода и качеството на семената за посев в горските разсадници и за залесяване;
- 2. извършване на масова и индивидуална селекция в горите;
- 3. оценка, маркиране и паспортизиране на плюсови и кандидат-елитни дървета;
- 4. одобряване (отмяна) и регистрация на базови източници на ГРМ от горски дървесни и храстови видове;
- 5. координация и контрол на дейностите по създаването и поддържането на базови източници от категориите „изпитан“ и „окачествен“ за производство на ГРМ;
- 6. оценка на състоянието и използването на одобрените и регистрирани базови източници на ГРМ;
- 7. контрол по стопанисването на одобрените и регистрирани базови източници на ГРМ;
- 8. водене на регистър на горската семепроизводствена база и поддържане на архив и база данни за нея;
- 9. извършване на фенологични наблюдения за установяване степента на цъфтежа и плодоносенето на горските дървесни и храстови видове и изготвяне на оценки и прогнози за очакваната реколта;
- 10. извършване на предварителен анализ за установяване годността на семенната реколта;
- 11. събиране, добив, търговия, внос и износ на ГРМ от видове и за цели, за които не се прилагат изискванията на наредбата по чл. 95, ал. 2, т. 2 ЗГ. 12. участие в цялостния процес по интродукция и реинтродукция на дървесни видове в горите и изготвяне на оценки за техния растеж; 13. извършване на дейности, наблюдения и оценки за съхранението, опазването и възпроизводството на горския генетичен фонд; 14. създаване и поддържане на семенни колекции (генна банка) от ценни местни дървесни видове и произходи по списък, утвърден от изпълнителния директор на ИАГ; 15. дългосрочно съхранение на семена от горски дървесни и храстови видове; 16. извършване на контрол по прилагане на законодателството в областта на производството, търговията, вноса и износа на ГРМ; 17. участие при планиране на дейностите в горската семепроизводствена база и приемане на областните и горскостопанските планове и програми; 18. разработване на проекти и участие в програми, финансирани от национални, европейски и други международни финансови институции в областите на дейност на станцията, след съгласуване с ИАГ; 19. извършване на услуги и дейности за трети лица след съгласуване с ИАГ; 20. извършване на административно обслужване, административни услуги и вътрешни административни услуги по смисъла на Закона за администрацията; 21. участие в комисии на ИАГ и регионалните дирекции по горите (РДГ), както и при писмена покана за участие в комисии на други институции и организации при осъществяване на контрол в района на дейност на станцията; 22. други дейности, възложени с нормативни и административни актове, както и дейности, възложени по силата на междуведомствени споразумения и договори или възложени от министъра на земеделието и храните или изпълнителния директор на ИАГ.