(1) Генералният директор:
- 1. организира, ръководи и контролира дейността на НВМС;
- 2. представя на министъра на земеделието и горите ежегоден доклад за дейността на НВМС;
- 3. ежегодно предлага за утвърждаване на министъра на земеделието и горите държавната профилактична програма (ДПП) по чл. 30 ЗВМД;
- 4. ежегодно представя на министъра на земеделието и горите проект на списък на болести по чл. 31, ал. 1 ЗВМД за внасяне в Министерския съвет;
- 5. одобрява годишните имунопрофилактични и диагностични планове на териториалните звена;
- 6. организира издаването на информационен бюлетин на НВМС;
- 7. предлага за утвърждаване на министъра на земеделието и горите националните мониторингови програми в областта на здравеопазването на животните и ветеринарно-санитарния контрол;
- 8. осъществява правомощията по възникване, изменение и прекратяване на служебните правоотношения и налага дисциплинарни наказания на държавните служители в НВМС;
- 9. назначава и освобождава директорите на специализираните структури и териториалните звена към НВМС;
- 10. извършва действия на управление на недвижимите имоти, предоставени на НВМС;
- 11. утвърждава научноизследователския план на НВМС;
- 12. утвърждава състава на Научния съвет на НВМС;
- 13. утвърждава със заповед състава на експертните съвети в НВМС.
(2) При осъществяване на правомощията си генералният директор издава заповеди.
(3) Със заповед генералният директор делегира правомощия на заместник генералния директор, главния секретар или на главния директор и определя техните функции.