Главният секретар е на пряко подчинение на председателя и осъществява общото ръководство на администрацията, като:
- 1. отговаря за изпълнение на възложените задачи, произтичащи от решенията на комисията и от заповедите на председателя;
- 2. оказва съдействие на председателя и на членовете на комисията при изпълнение на техните правомощия;
- 3. координира разпределението на задачите за изпълнение между административните звена и контролира спазването на сроковете за изпълнението им;
- 4. организира провеждането на заседанията и съставя проект за дневен ред на редовните заседания на комисията;
- 5. координира и контролира подготовката на материалите за заседанията на комисията;
- 6. подготвя и организира срещи на комисията, свързани с изпълнение на правомощията й;
- 7. следи за изпълнение на разпорежданията на председателя, решенията на комисията и сроковете за тяхното изпълнение;
- 8. подпомага комисията със становища при осъществяване на правомощията й;
- 9. организира и отговаря за изготвяне на проектите на вътрешни актове на комисията;
- 10. координира и контролира дейностите, свързани с обучението и повишаването на квалификацията на служителите;
- 11. предлага за утвърждаване функционалните характеристики на звената в администрацията на комисията;
- 12. утвърждава длъжностните характеристики на служителите след одобрението им от комисията;
- 13. организира, координира и контролира дейностите по атестиране на служителите в администрацията;
- 14. изготвя доклади за състоянието и натовареността на администрацията и ги представя на комисията;
- 15. координира и контролира изграждането на единна информационно-комуникационна инфраструктура, осигуряваща дейността на комисията и на нейната администрация;
- 16. организира и отговаря за управлението на ползваните за административни нужди недвижими имоти, предоставени на комисията, и на движимите вещи;
- 17. организира и контролира съхраняването на документите и другите носители на информация, както и предоставянето на публичната информация на гражданите, юридическите лица и държавните органи;
- 18. ръководи, координира и контролира документооборота;
- 19. организира, координира и контролира цялостната дейност по подготовката, отпечатването и разпространяването на годишния доклад на комисията;
- 20. съвместно с директора на дирекция „Административно-правно и информационно обслужване“ организира дейността, свързана с предоставянето на достъп до обществена информация;
- 21. подписва изходящата кореспонденция на комисията, която не е във връзка с образувани производства по смисъла на Закона за отнемане в полза на държавата на незаконно придобито имущество, освен когато писмото е адресирано до министър или ръководител на държавен орган или институция;
- 22. изпълнява и други дейности, възложени от председателя.