Специализираната администрация е организирана в три дирекции:
(Изм. - ДВ, бр. 29 от 2015 г., в сила от 21.04.2015 г., изм. - ДВ, бр. 66 от 2018 г., в сила от 10.08.2018 г., изм. - ДВ, бр. 92 от 2019 г., в сила от 22.11.2019 г.) Специализираната администрация е организирана в три дирекции:
- 1.(изм. - ДВ, бр. 92 от 2019 г., в сила от 22.11.2019 г.) дирекция "Горски територии";
- 2.(изм. - ДВ, бр. 92 от 2019 г., в сила от 22.11.2019 г.) дирекция "Горско стопанство";
- 3.(изм. - ДВ, бр. 66 от 2018 г., в сила от 10.08.2018 г., изм. - ДВ, бр. 92 от 2019 г., в сила от 22.11.2019 г.) дирекция "Контрол по опазване на горските територии и ловно стопанство".
- 4.(отм. - ДВ, бр. 92 от 2019 г., в сила от 22.11.2019 г.)
- 5.(изм. - ДВ, бр. 66 от 2018 г., в сила от 10.08.2018 г., отм. - ДВ, бр. 92 от 2019 г., в сила от 22.11.2019 г.)
- 6.(нова - ДВ, бр. 66 от 2018 г., в сила от 10.08.2018 г., отм. - ДВ, бр. 92 от 2019 г., в сила от 22.11.2019 г.)