(1) Агенцията се ръководи и представлява от председател, който се определя с решение на Министерския съвет и се назначава от министър-председателя.
(2) Председателят ръководи и представлява агенцията.
(3) Председателят на агенцията е първостепенен разпоредител с бюджетни кредити.
(4) Председателят на агенцията осъществява правомощията си пряко и чрез структурите и специализираните териториални звена на агенцията.