Органи на управление на предприятието са:
- 1.(изм. - ДВ, бр. 55 от 2017 г., в сила от 07.07.2017 г., изм. - ДВ, бр. 9 от 2024 г., в сила от 01.02.2024 г.) министърът на земеделието и храните;
- 2. управителният съвет;
- 3.(отм. - ДВ, бр. 28 от 2018 г., в сила от 29.03.2018 г.)