Агенцията е администратор на приходите от:
- 1.(изм. - ДВ, бр. 14 от 2014 г., в сила от 18.02.2014 г.) субсидии от държавния бюджет;
- 2. собствена дейност;
- 3. събрани суми от глоби и имуществени санкции, наложени с наказателни постановления, издадени при осъществяването на контрола по реда на Закона за енергийната ефективност (ЗЕЕ), Закона за енергията от възобновяеми източници (ЗЕВИ) и нормативните актове по прилагането им;
- 4. международни програми и споразумения;
- 5. други източници, определени с нормативен акт на Министерския съвет.