(1)(Изм. - ДВ, бр. 44 от 2001 г., изм. - ДВ, бр. 70 от 2003 г., изм. - ДВ, бр. 76 от 2008 г., в сила от 01.09.2008 г., изм. - ДВ, бр. 84 от 2010 г.) Агенцията е структурирана в две главни дирекции и дирекция.
(2)(Изм. - ДВ, бр. 107 от 2000 г., в сила от 1.01.2001 г., изм. - ДВ, бр. 88 от 2001 г., в сила от 15.10.2001 г., изм. - ДВ, бр. 39 от 2002 г., изм. - ДВ, бр. 70 от 2003 г., изм. - ДВ, бр. 111 от 2003 г., изм. и доп. - ДВ, бр. 76 от 2008 г., в сила от 01.09.2008 г., изм. и доп. - ДВ, бр. 84 от 2010 г., изм. - ДВ, бр. 77 от 2013 г., в сила от 03.09.2013 г.) Общата численост на персонала в организационните структури и административните звена на агенцията е 86 щатни бройки, включително изпълнителен директор, главен секретар и финансов контрольор. Числеността на отделните административни звена в агенцията е посочена в приложението.