(1) Администрацията на басейновите дирекции е обща и специализирана.
(2)(Изм. - ДВ, бр. 58 от 2012 г., в сила от 01.08.2012 г.) Общата администрация е организирана в дирекция "Административни, финансови и правни дейности".
(3)(Изм. - ДВ, бр. 58 от 2012 г., в сила от 01.08.2012 г.) Специализираната администрация е организирана във:
- 1. дирекция "Планове и разрешителни";
- 2. дирекция "Контрол".
(4)(Изм. - ДВ, бр. 58 от 2012 г., в сила от 01.08.2012 г.) При необходимост към дирекциите могат да се създават отдели, а към отделите сектори.
(5)(Нова - ДВ, бр. 58 от 2012 г., в сила от 01.08.2012 г.) При необходимост могат да се определят длъжности с място на работа, различно от седалището на съответната басейнова дирекция.